骨质疏松是以骨量减少和骨组织纤维结构退化为主要特征的疾病，现代研究表明淫羊藿具有抗骨质疏松的作用。

淫羊藿可调节骨细胞生长、增殖、分化和凋亡。相关研究表明淫羊藿总黄酮对核结合因子的表达有促进作用，从而促进成骨细胞的分化。另有学者从血清药理学角度对其作用机制进行研究，结果显示淫羊藿总黄酮对细胞增殖无明显影响，而其含药血清却表现出强烈的刺激细胞增殖活性并显着提高骨钙素的分泌量、矿化结节数和钙盐沉积量，延长骨保护素信使RNA的表达，抑制骨保护素配体信使RNA的表达，推测作用的直接物质基础并非淫羊藿总黄酮，而与其吸收入血的淫羊藿总黄酮代谢产物及其诱生物有关。

淫羊藿可抑制破骨细胞作用。淫羊藿苷可降低破骨细胞内Ca2+浓度，可能引起肌动蛋白环回缩和细胞内超氧阴离子自由基减少，导致吸收陷窝面积减小，进而抑制破骨细胞的吸收功能。相关研究表明淫羊藿可能通过黄酮类化合物抑制前破骨细胞株的增殖，进而抑制前破骨细胞株分化成破骨细胞而发挥抗骨质疏松的作用。