假性幽门化生是多数是由于慢性萎缩性胃炎而产生，而引起慢性萎缩性胃炎的病因和发病机制一般认为在免疫因素、胆汁反流、生物因素、药物因素以及急性胃炎、口腔和鼻咽感染等的影响下，加之情志失调、饮食不节、过度疲劳、失眠、受凉等。

引起胃粘膜慢性炎症，使胃粘膜表面反复受到损害，久之导致胃分泌腺体萎缩，胃粘膜变色、变薄、血管显露，胃酸分泌减少，消化功能减弱，胃蠕动功能失调等，从而形成慢性萎缩性胃炎。中医认为脾胃虚弱、气机壅滞是慢性萎缩性胃炎的基本病理机制。
　　老年阴亏、七情内伤、饮食痰积、久病致瘀诸因素都可使脾胃功能受损，升降无力，气机运行不畅，而呈现胃脘部胀满、隐痛、纳差、乏力等症状。本病属本虚标实、寒热错杂之证，以正虚为本，正越虚则邪越结，邪越结则正越虚，常互相影响，难以速愈。可能与下列因素有关：
　　1、慢性浅表性胃炎的继续：慢性萎缩性胃炎可由慢性浅表性胃炎发展而来，6个医院报告经5～8年的随访观察浅表性胃炎164例，其中34例转变成慢性萎缩性胃炎（20.7％）。慢性浅表性胃炎的病因，均可成为慢性萎缩性胃炎的致病与加重因素。
　　2、遗传因素：根据调查，慢性萎缩性胃炎病人的第一代亲属间，慢性萎缩性胃炎的发病率明显增高，恶性贫血的遗传因素也很明显。有亲戚关系的发病率比对照组大20倍，说明慢性萎缩性胃炎可能与遗传因素有关。
　　3、金属接触：铅作业工作者胃溃疡发病率高，胃粘膜活组织检查发现萎缩性胃炎发病率也增高。称之为排泄性胃炎。除铅外很多重金属如汞、碲、铜及锌等对胃粘膜都有一定的损伤作用。

４、放射：放射治疗溃疡病或其他肿瘤，可使胃粘膜损伤甚至萎缩。

５、缺铁性贫血：很多事实说明缺铁性贫血与萎缩性胃炎关系密切，报道缺铁性贫血50例，正常胃粘膜、浅表性胃炎及萎缩性胃炎各占14％、46％及40％。但是贫血引起胃炎的机理尚不明了。

有些学者认为胃炎是原发病，因为胃炎胃酸低致铁不能吸收，或因胃出血以致形成贫血，另一种意见认为先有贫血，因为身体内铁缺乏使胃粘膜更新率受影响而容易发生炎症。