急性或慢性的炎症可以引起内膜基底层的破坏，宫腔手术操作，人流术、清宫术，宫腔镜下子宫肌瘤或息肉电切术等，都有可能会损伤内膜，子宫动脉栓塞或肌瘤射频消融术后也可引起子宫内膜薄，除外上述因素，极少部分患者内膜厚度始终菲薄，可能与内分泌状态、年龄、内膜腺体发育不良、雌孕激素受体缺乏、突然环境改变、工作压力大等有关。