一般在临床上巧克力囊肿不会是急性的，因为巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，这时具有生长功能的以子宫内膜移位在了卵巢里面，每个月月经来潮时，卵巢受激素水平的刺激也会存在内膜出血，从而长期形成囊肿，里面的液体，慢慢形成巧克力样的液体。所以我们在临床上称之为巧克力囊肿，这是由于子宫内膜异位病灶所引起的，这种病灶往往会破坏正常的卵巢组织，从而引发炎症。而且当卵巢巧克力囊肿长到一定程度时，也有可能会发生破裂，或者是受到撞击时也会发生破裂，从而引起盆腔出血、感染，造成患者出现急性的腹部疼痛。

如果卵巢巧克力囊肿已经破裂，建议应该立即进行手术，将破裂的囊肿切除，并且在术中尽量清洗盆腔，主要的目的是将盆腔内的破碎的囊液全部清洗干净，避免具有活性的子宫内膜移位的细胞，种植在其他的脏器上，以免引起盆腔的内膜异位症。建议患者在术后应该给予达菲林治疗半年，避免囊肿的复发。另外也可以在宫腔内放置曼月乐环，主要的目的使子宫内膜萎缩，从而达到治疗子宫内膜异位症的目的，避免卵巢巧克力囊肿复发那么，此类患者在术后一定要进行定期的复查，每半年做一次超声检查。

巧克力囊肿在发病早期时，有一部分患者是没有明显症状的。由于卵巢巧克力囊肿位于盆腔的深部，在有一部分患者早期实是没有症状的；有一部分患者在发病的早期会出现下腹部的疼痛，经期疼痛明显，而且这种疼痛有时会下会阴部、肛门、大腿等部位进行放射，经期疼痛的症状较为严重，甚至需要服用止痛药。一部分患者在性生活时，由于子宫的收缩上提会引发性交痛，甚至还会伴随点滴出血的症状，长时间性欲低下；一部分早期卵巢巧克力囊肿的患者会出现月经的异常，比如月经量增多，经期延长、月经淋漓不止者，不能及时调理，甚至还会出现贫血的现象。

巧克力囊肿是属于最常见的子宫内膜异位症，不但会引起进行性加重的痛经表现，还可能因为囊肿过大，而出现卵巢囊肿的破裂或者扭转，甚至会影响女性的生育功能，导致女性不能正常怀孕。所以对于检查发现有卵巢巧克力囊肿的女性，一般当巧克力囊肿超过5厘米以上，就需要考虑行手术进行治疗，在囊肿没有破裂的情况下，可以行腹腔镜微创手术，因为这类手术切口比较小，术后恢复又比较快。但对于已经出现囊肿破裂或者扭转的女性，就可能需要行开腹手术进行切除。术后还需要肌注亮丙瑞林，或者曲谱瑞林来继续治疗，其目的就是为了预防巧克力囊肿的再次复发。因为在手术的过程中，可能没办法将异位的子宫内膜组织完全清除干净，所以最好进行继续药物治疗。

巧克力囊肿治疗方法有手术治疗、药物治疗、放置宫内节育器等，主要是根据患者的年龄、生育要求的综合评估。1、对无生育要求，年龄45岁左右、症状重、病灶累及重要脏器或多种治疗无效者，建议行全子宫双附件切除术根治。双侧卵巢切除后，没有激素的支持，异位的病灶会萎缩退化消失。2、对于年轻要求生育的患者和不孕症患者经全面检查排除其不孕因素，首先应该尽早在腹腔镜下明确诊断，分离盆腔粘连，去除肉眼可见的病灶，恢复正常的解剖结构。保留子宫和卵巢。手术可以明确诊断，排除恶性肿瘤，缓解疼痛，改善生活质量，能显着提高轻度内异症的自然妊娠率。然后药物抑制内异症的残余病灶，改善盆腔的免疫环境，抑制雌激素水平。最后，建议中重度患者尽早积极采用辅助生殖技术助孕。不应长期期待或药物治疗。3、对无生育要求较年轻的患者可以选择腹腔镜手术去除病灶，保留卵巢和子宫，宫内放置曼月乐的方法，曼月乐是一种含有孕激素的宫内节育器，即可以避孕，又可以缓解痛经和月经过多的症状，预防内异症复发。如果没有口服避孕药禁忌症的患者也可以长期服用避孕药。