甲状腺炎会选择青霉素类的抗生素，切开引流，药物治疗，饮食低碘的摄入以及生活规律。
甲状腺炎治疗要具体分是哪一种类型的甲状腺炎。急性甲状腺炎，是由于细菌感染导致，而且全身的症状会非常的明显，抗生素的使用非常重要，往往会选择青霉素类的抗生素，对急性甲状腺炎的效果会相对比较明确的。当然对于严重的急性甲状腺炎，导致呼吸道滞涩或者说吞咽困难、呼吸阻塞的患者及时的进行外科的切开引流。
亚急性甲状腺炎，由于是一个病毒感染导致抗病毒治疗，目前西药没有刻意性的药物，往往是采取对症治疗，疼痛发烧比较明显，采用非甾体消炎药，如芬必得或者说阿司匹林等等类似药物都可以使用。亚急性甲状腺炎合并了甲状腺毒症，出现了高代谢症状，心慌、乏力、出汗等等可以采取对症治疗。如β受体阻滞剂可以控制心率，安定的药物可以改善睡眠稳定情绪。中医中药对亚急性甲状腺炎有比较好治疗效果，对于慢性甲状腺炎因为以免疫性的损伤为主，所以说在甲状腺功能正常的阶段，慢性甲状腺炎往往没有特异性治疗方法。饮食低碘的摄入以及生活规律，对于预防甲减的发生有一定的作用。对于慢性甲状腺炎这种免疫性的损伤，要注意是否合并其系统的免疫性疾病，存在像风湿免疫性疾病，需要抑制免疫的药物治疗，这一部分患者可以根据患者具体情况选择中医中药治疗。